El objetivo del proyecto OBIND es crear un sistema informático en el ámbito oncológico que permita la agregación y el análisis de conjuntos de datos heterogéneos, centrado en el estudio de las interacciones entre diferentes moléculas biológicas que se ven alteradas en las enfermedades tumorales, con el fin de establecer un enfoque racional en el diseño de nuevas terapias.

EL PROYECTO DE INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO

El estudio de patologías complejas, como las neoplásicas, requiere un enfoque integrado de análisis de datos. Además del análisis de los genes implicados en el proceso de transformación de las células normales en células tumorales (se han identificado más de 500), el estudio de la aparición de un tumor también requiere el análisis de las interacciones entre proteínas, ARN y moléculas pequeñas.
El diseño farmacéutico de nuevas terapias antitumorales especializadas y personalizadas es un proceso muy complejo; de hecho, el desarrollo de nuevas entidades químicas (NCE) requiere, de media, 13 años y unos costes cercanos a los mil millones de euros. El estudio del comportamiento de toda la red de interacciones moleculares permite predecir los efectos de una terapia a una escala más amplia que la de una sola interacción. Previa a dicha análisis es la consulta de bases de datos especializadas disponibles en la web o en los centros de investigación.

Los problemas relacionados con el análisis de los datos necesarios para el estudio de los tumores y el desarrollo de nuevos fármacos son la presencia de grandes cantidades de datos biomédicos de difícil consulta y manipulación, la fragmentación que no permite tener una visión global de los problemas relacionados con la patología de interés y la escasa interoperabilidad causada por la variedad de formatos o la ausencia de estructuración.

El proyecto de investigación y desarrollo se propone optimizar:

• la selección de datos útiles para el estudio de las patologías tumorales de interés, a través de un motor de búsqueda semántico conectado a las principales bases de datos de proteómica, transcriptómica, interactómica, quimio-genómica, biología estructural y química médica;
• el análisis integrado de diferentes tipos de datos, con el fin de identificar las interacciones biológicas entre pequeñas moléculas, ARN y proteínas que influyen, o podrían influir, en la aparición, la evolución y/o la regresión de la patología tumoral;
• el aprovechamiento de nuevos enfoques estadísticos y computacionales que intervienen en el procesamiento de datos y de modelos de análisis integrado de múltiples fuentes de datos;
• la extrapolación de información estructural de moléculas protegidas por patentes (scaffold) para poder incluirla en el flujo de trabajo de diseño de nuevas terapias.

Socios

• Exprivia S.p.A. – líder del proyecto
• Universidad de Palermo
• Fundación Ri.MED
• Securproject
• OS2
• 2038 Innovation Company
• IRIB-CNR